IntelコンパイラーでLammpsは早くなるのか？
いつの間にやらintel compilerが無料で手に入るようになっている。すごい時代だ。昔はインテルコンパイラを使うとプログラムが爆速になったイメージがあるが、最近はどうなのだろうか。Lammpsで比較してみる。 対象マシン 対象とするマシンスペックは以下。 Intel(R) Core(TM) i7-7700K CP...
カテゴリー: MD
OVITOのレンダリングを自動化
MD計算のあとはやっぱりビジュアライズしたい。昔はAtomeyeを使っていたが、最近はOVITOを使っている。超優秀なのにフリーで使える素晴らしいソフトウェアだ。 OVITOを使うときは、下記のような手順でレンダリングに至る。 近年、コンピュータの高度化により、MD計算は大量の計算結果を吐き出せるようになった。データが...
MacでLammps
分子動力学のフリーソフトLammpsがMacだと一瞬で環境整えられる。 分子動力学法 分子動力学法（ぶんしどうりきがくほう、英: molecular dynamics、MD法）は、原子ならびに分子の物理的な動きのコンピューターシミュレーション手法である。 Wikipedia（https://ja.wikipedia.o...